EPB 2018 UTFPR-CP

Apresentação

A Escola Paranaense de Bioinformática, em sua primeira edição, é uma evolução natural do Workshop de Bioinformática realizado desde 2015 na Universidade Tecnológica Federal do Paraná - Campus Cornélio Procópio (UTFPR-CP).

Nesse sentido, mudou-se de um evento de demanda regional, para um evento de amplitude estadual que envolvem, incialmente, quatro instituições do Paraná: a UTFPR (sede de 2018), a Universidade Estadual de Londrina (UEL), Instituto Carlos Chagas/Fundação Oswaldo Cruz, e a Universidade Federal do Paraná (UFPR).

O objetivo é apoiar e incentivar a Bioinformática, bem como a formação de recursos humanos, para o Brasil e no estado do Paraná. Neste ano, serão ministrados cursos e apresentadas palestras no contexto de pesquisas em bioinformática, envolvendo conceitos introdutórios e também aplicações práticas, os quais são fundamentais para a compreensão de diferentes problemas biológicos, como também as soluções computacionais envolvidas.

Público-alvo: Estudantes de graduação, pós-graduação, professores, pesquisadores e profissionais das áreas de Bioinformática, Engenharias e Ciências da Computação, Ciências Biológicas, Matemática e Estatística, Física, Química e áreas correlatas.

Notícias

A submissão de resumos deverá ser feita
aqui.

Curta a página do evento no facebook e acompanhe as novidades!

Datas Importantes

Edição 2018 acontecerá entre os dias 8 - 10 de Outubro de 2018.
Universidade Tecnológica Federal do Paraná Av. Alberto Carazzai,1640 - Centro Cornélio Procópio, PR 86300-000
Submissão de trabalhos até 16/09/2018

Comissão Organizadora

Professores da UTFPR-Cornélio Procópio:
André Yoshiaki Kashiwabara
Alexandre Rossi Paschoal
Fabrício Martins Lopes
Fabio Fernandes da Rocha Vicente
Danilo Sipoli Sanches
Douglas Silva Domingues (UNESP-Rio Claro)
José Eduardo de Lima Simão

Programação Prevista

Veja a programação completa do evento.

08 de Outubro (Segunda-feira)
Horário	Palestrante	Palestra
09:00	André Yoshiaki Kashiwabara UTFPR (Cornélio Procópio) Lattes
10:00	André Yoshiaki Kashiwabara UTFPR (Cornélio Procópio) Lattes	A definir ` A definir
11:00	André Yoshiaki Kashiwabara UTFPR (Cornélio Procópio) Lattes	A definir A definir
12:00	Almoço
13:30	Laurival Antonio Vilas Bôas(UEL) Lattes	Caracterização “in silico” de RNAs não codificadores no Grupo do Bacillus cereus e validação molecular m Bacillus thuringiensis.
14:20	GDM Genética do Brasil Ltda site	A definir A definir
15:10	Alan Mitchell Durham (USP) Lattes	Desenvolvimento de Software e Bioinformática Nesta palestra iremos falar sobre abordagens mais maduras de desenvolvimento de software e como elas podem beneficiar o desenvolvimento de sisemas em bioinformática. Abrodaramos também como esta visão levou a alguns resultados práticos em nosso grupo.
16:00	Pôster Café
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09 de Outubro (Terça-feira)
Horário	Palestrante	Palestra
09:00	Fabio Fernandes da Rocha Vicente - UTFPR Lattes	A definir A definir
10:00	Fabio Fernandes da Rocha Vicente UTFPR Lattes	A definir Resumo indisponível no momento.
11:00	Fabio Fernandes da Rocha Vicente - UTFPR Lattes	A definir Resumo indisponível
12:00	Almoço
13:30	Luiz Filipe Protasio Pereira IAPAR/Embrapa Café Lattes	Identificação de genes da via de biossíntese de diterpenos de café através de estudos de genômica funcional e de associação genômica ampla Resumo indisponível
14:20	Rogério Margis UFRGS Lattes	Estratégias para identificação de circRNAs e de novos peptídeos Resumo indisponivel
15:10	Paulo Costa Carvalho FioCruz-ICC Lattes	PatternLab: um ambiente computacional para proteômica Um dos objetivos da proteômica shotgun é comparar o perfil proteico de amostras biológicas em diferentes estados (e.g., controle versus doente). Para isso, frequentemente se faz uso de cromatografia liquida acoplada a espectrometria de massas de alta resolução. O ambiente computacional PatternLab for Proteomics (PL) é uma solução completa para analise de dados gerados por este tipo de procedimento. Aqui, apresentarei este ambiente computacional e estudos de caso que permitem ilustrar particularidades do PL que o tornam único. PL é livre para uso acadêmico e está disponível no seguinte endereço: http://patternlabforproteomics.org .
16:00	Pôster Café
--------------
10 de Outubro (Quarta-feira)
Horário	Palestrante	Palestra
09:00	Mauro Castro UFPR Lattes
10:00	Mauro Castro UFPR Lattes	A definir Resumo indisponivel
11:00	Mauro Castro UFPR Lattes	A definir Resumo indisponivel
12:00	Almoço
13:30	Douglas Domingues UNESP Rio Claro Lattes	Genômica em plantas - da Biologia Computacional a Biologia Molecular O desenvolvimento de estratégias computacionais para a identificação de componentes do genoma eucarioto é fortemente associada a estudos na área da saúde e genética humana (ou modelos mamíferos). Uma das principais razões para este viés era a fartura de dados genômicos de espécies de vertebrados, bem como o genoma humano. No entanto, com o advento do sequenciamento de alto rendimento, atuamente temos disponível publicamente o sequenciamento de dezenas de genomas vegetais, especialmente de espécies de interesse agronômico. Esta mudança de paradigma na Genômica não foi acompanhada na mesma velocidade em Bioinformática/Biologia Computacional. Nesta apresentação, apresentarei dois casos de estudo em Bioinformática no qual uma das principais novidades está no uso de dados genômicos vegetais, bem como a potencial aplicação destes casos em um exemplo de Biologia Molecular de Plantas.
14:20	Mauro Castro UFPR Lattes	Cancer Systems Biology: methods, challenges and perspectives The size and complexity of the molecular data generated by functional genomics techniques require a continuous search for innovative methods. With the increase in scale and consequent decreasing per-unit costs for generating data by next-generation sequencing technologies, one of the challenges is to propose intelligent methods able to extract useful information from large-scale molecular data. This talk will present systems biology algorithms and strategies used to reconstruction regulatory interactions in breast cancer. In particular, the focus will be on the combination of computational and experimental approaches aiming the functional follow-up of genome-wide association studies (GWAS).
15:10	Fabio Passetti - FioCruz/ICC Lattes	Desenvolvimento de abordagem de proteogenômica para desvendar proteoformas expressas nos cérebros humano e murino. Os avanços obtidos em transcriptômica, em função do desenvolvimento de sequenciadores de alta vazão, e na proteômica, por meio dos modernos espectrômetros de massas (MS), resultaram em um grande volume de dados que passou a ser integrado em diversos estudos de Bioinformática, levando ao melhor entendimento sobre a fração dos RNAs mensageiros efetivamente traduzidos em proteínas. A proteogenômica é a área de pesquisa que reúne estas tecnologias, atuando na interface entre a genômica e a proteômica para interpretar eventos moleculares tais como, por exemplo, o splicing alternativo. Este evento molecular é capaz de gerar RNAs mensageiros diferentes a partir de um mesmo gene, podendo alterar a sequência polipeptídica e, consequentemente, gerar proteoformas com funções distintas. Neste sentido, atualmente alguns projetos têm realizado esta análise integrativa com o intuito de comparar os resultados de amostras de ser humano e outros mamíferos, uma vez que alguns destes animais são utilizados como organismos modelo para o estudo dos aspectos moleculares de doenças. Serão apresentados resultados nesta palestra do perfil de expressão de variantes de splicing alternativo em dados de espectrometria de massas de proteínas de amostras de tecidos de cérebros sadios de humano e camundongo. Serão demonstrados exemplos de peptídeos compartilhados entre o cérebro humano e de camundongo, pertencentes à proteoformas de genes ortólogos.
16:00	Pôster Café
17:00	Encerramento e premiações

Inscrição

Convidamos a todos os estudantes, pesquisadores e integrantes do setor privado que estudam, utilizam e (ou) se interessam pelo tema Bioinformática a se inscreverem na Escola Paraenense de Bioinformática 2018 - Campus Cornélio Procópio.

Valor da inscrição: R$ 20,00*.
clique aqui
*Pagamento preferencialmente nas agências da caixa econômica federal ou lotéricas.

Todos os participantes estão convidados a enviarem um resumo do seu trabalho para a EPB 2018 - UTFPR-CP.
Os trabalhos selecionados serão apresentados em formato de pôster durante o evento, oferecendo a oportunidade de discussão e interação entre os participantes.
Para mais informações sobre submissão acesse a seção submissão.

Submissão

Normas de submissão

Autores são convidados a submeter resumos de trabalhos originais, concluídos ou em andamento, relacionados com a área de Bioinformática.

Pôster

Para seleção de posters deverá ser submetido um resumo.
Instruções para o Resumo:

Informar título do trabalho;
Todos os autores, afiliações, e agências financiadoras devem ser declaradas;
O resumo deve ser em português;
O resumo deve ter entre 200 e 400 palavras;
Não conter figuras, tabelas, ou referências;
Sugerimos a presença da descrição de resultados preliminares;

Período de Submissão:

De 28/06/2018 até 16/09/2018 às 23h55min (Horário de Brasília);

Enviar o trabalho (em formato PDF).
O formato do pôster deve seguir as recomendações abaixo:
Obrigatórios: título do trabalho, nome e instituição do aluno e dos orientadores, agência(s) financiadora(s) do trabalho (se houver) e palavras-chave que identificam o trabalho.
Clique aqui para submeter.

Os melhores trabalhos serão escolhidos e serão premiados.

Em caso de dúvidas escreva para
fabiofernandes@utfpr.edu.br

Instruções para elaboração do pôster para o EPB 2018

Tamanho

Largura: 80 a 90cm
Altura: 100 a 120cm
Disposição visual O pôster pode ser feito em papel, lona ou outro material adequado. Não é necessário que o pôster seja confeccionado com o cordão para pendurar, mas é recomendável se for impresso em lona.

Modelo/ Template

Não há um modelo visual padrão para o pôster.
No entanto, é recomendável que contenha os seguintes elementos:
Título
Lista de autores e respectivas instituições
Seções:

Introdução;
Metodologia;
Resultados e Conclusões;
Referências bibliográficas principais.

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Hospedagem

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Fachada UTFPR-CP

Vista noturna da cidade

Fachada noturna UTFPR-CP

Laboratório de Informática

Palestra 3 (WB2015)

Vista do Cristo

Anfiteatro

UTFPR - CP

Abertura (WB2015)

Monumento Cristo Rei

Palestra 3 (WB2015)

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